U Odsjeku za kontrolu spoljnotrgovinskog prometa strateških roba, obavljaju se poslovi – osnovne djelatnosti, i to:

Poslovi upravnog rješavanja koji obuhvataju: pružanje pravne pomoći davanjem stručnih objašnjenja, sastavljanje podnesaka i vršenje drugih poslova pravne pomoći vezano za poslove registracije fizičkih i pravnih lica koja se bave izvozom/uvozom, tranzitom kao i izdavanja dozvola za izvoz, uvoz i tranzit oružja i vojne opreme, proizvoda i tehnologija dvojne namjene, proizvoda posebne namjene i hemikalija sadržanih u Aneksu o hemikalijama koji je sastavni dio Zakona o provedbi Konvencije o zabrani razvoja, proizvodnje, gomilanja i upotrebe hemijskog oružja i o njegovu uništavanju (u daljem tekstu: Aneks o hemikalijama).

Poslovi upravnog nadzora koji obuhvataju: nadzor nad zakonitošću akata iz oblasti: izvoza/uvoza, posredovanja u prometu oružja i vojne opreme, proizvoda i tehnologija dvojne namjene, proizvoda posebne namjene i hemikalija sadržanih u Aneksu o hemikalijama;

Normativno pravni poslovi koji obuhvataju: izradu prednacrta, nacrta i prijedloga zakona, drugih propisa i opštih akata, kao i pripremanje izmjena i dopuna tih propisa a što se odnose na izvoz/uvoz, tranzit, sredstava oružja i vojne opreme, proizvoda i tehnologija dvojne namjene, proizvoda posebne namjene i hemikalija sadržanih u Aneksu o hemikalijama; stručnu obradu tematskih i drugih pitanja koja služe za izradu zakona, drugih propisa i akata iz oblasti vezanih za kontrolu prometa naoružanjem i vojnom opremom, proizvoda i tehnologija dvojne namjene, proizvoda posebne namjene i hemikalija sadržanih u Aneksu o hemikalijama.

Studijsko-analitički poslovi koji obuhvataju: izradu analiza, izvještaja, informacija i drugih stručnih materijala iz oblasti osnovne djelatnosti Odsjeka; stručnu obradu sistemskih rješenja od značaja za oblasti osnovnih djelatnosti Odsjeka, izradu analitičkih, informativnih i drugih materijala u okviru propisane metodologije;

Stručno-operativni poslovi koji obuhvataju: provođenje politike i izvršavanje zakona, drugih propisa i opštih akata i s tim u vezi utvrđivanje stanja u oblasti dozvola; izdavanje dozvola za izvoz, uvoz oružja i vojne opreme, proizvoda i tehnologija dvojne namjene, proizvoda posebne namjene i hemikalija sadržanih u Aneksu o hemikalijama, registraciju fizičkih i pravnih lica koja se bave izvozom/uvozom i posredovanjem u prometu oružja i vojne opreme; registraciju fizičkih i pravnih lica koja se bave posredovanjem u izvozu/uvozu i reeksportu oružja i vojne opreme; registraciju ugovora o proizvodnoj saradnji (istraživanje, usavršavanje, tehičku razmjenu) oružja i vojne opreme; uspostavljanje, izradu, vođenje i održavanje evidencije – registara lica koja se bave izvozom/uvozom, tranzitom, kao i izdavanjem dozvola za izvoz, uvoz i posredovanje u prometu oružja i vojne opreme, proizvoda i tehnologija dvojne namjene i proizvoda posebne namjene i hemikalija sadržanih u Aneksu o hemikalijama; učestvuje u ažuriranju “Zajedničkog popisa vojne opreme obuhvaćene pravilima ponašanja EU u postupku kod izvoza oružja“ i “ Kontrolne liste EU roba i tehnologija dvojne namjene“, izrada liste “ Roba posebne namjene“; saradnju s nadležnim tijelima BiH i entiteta, te međunarodnim institucijama koje imaju nadležnost iz oblasti kontrole prometa roba koje se nalaze na režimu uvoza/izvoza “D”, vođenje baze podataka.